島式1面2線で、構内踏切があります。直営駅で、窓口の営業時間は9:10〜17:25となっていました。佐久間高校の学生の利用が多い。かつては佐久間レールパークがありましたが、すでに撤去済みでした。
佐久間レールパークは、2009年(平成21年)11月1日に閉園しました。