ホームは島式1面2線で無人駅。出入口は地下通路で線路をくぐる形になっており、自由通路も兼ねています。駅前の小道を抜けるとすぐ近鉄長島駅につきます。寂しさ漂うJR長島駅に比べ、利用者が多く活気があるように見えました。
簡易TOICA改札機が設置されました。