島式1面2線のホームをもつ無人駅。ホームと駅舎は構内踏切で結ばれています。 周辺は新しい住宅が建ち並んでいましたが、駅舎や上家はたいへん古い木造建築が残っています。
東釧路駅の周辺には踏切が無く、駅西側の人道跨線橋を渡るか、東側の道路と一体化した跨線橋を渡るくらいしか方法がありません。