2面3線の橋上駅。東口の階段を下りると関東鉄道佐貫駅があります。
改札機がバーレスになり改札機真上の案内板が撤去されていました。東出入口の庇『佐貫駅東口』と書かれていた部分に、『スポーツ健康宣言都市 龍ケ崎市』という看板が付いています。